Sepanjang sejarah, manusia telah berselisih dengan Beastmen-sebuah spesies yang mampu berubah bentuk karena “Faktor Binatang” genetik mereka. Karena konflik ini, para Beastmen terpaksa bersembunyi. Kota Anima berfungsi sebagai tempat yang aman bagi mereka yang tertindas untuk hidup bebas dari campur tangan manusia.
Selama festival yang merayakan ulang tahun ke-10 kota tersebut, Michiru Kagemori, seorang manusia yang tiba-tiba berubah menjadi tanuki, menemukan bahwa Kota Anima sangat jauh dari surga. Setelah menyaksikan ledakan di alun-alun, dia dihadapkan oleh Shirou Ogami, serigala yang tampaknya tidak bisa dihancurkan dan pelindung bersumpah semua Beastmen. Saat mereka mengejar penjahat di balik pengeboman tersebut, keduanya menemukan bahwa Michiru bukanlah Beastman biasa, dan berusaha menyelidiki masa lalu yang misterius dan kemampuannya yang luar biasa. Mungkinkah dia menjadi mata rantai yang hilang antara Manusia dan Beastmen?
