Rata-rata siswa SMA Yuuko Konagai cenderung pemalu dan canggung dalam pergaulan. Karena itu, selain mendapat nilai yang biasa-biasa saja, dia hampir tidak punya teman di kelasnya. Namun, setelah hari yang monoton di sekolah, dia kembali ke surga yang telah lama ditunggu-tunggu—rumah bersama kucingnya Maa, Shi, dan Ro! Dengan kepribadian unik mereka, ketiganya memiliki tubuh yang mirip dengan manusia, namun tetap memiliki kemampuan untuk berbicara dan berkomunikasi. Setiap hari, kelompok menggemaskan ini menunggu kembalinya pemiliknya untuk menghujaninya dengan persahabatan yang sangat dibutuhkan.
Nyanko Days menyoroti kehidupan Yuuko dan kucing-kucingnya saat mereka mencerahkan setiap momen dan mendapatkan teman baru dari hari ke hari.
