Siswa kelas lima yang banci, Shuuichi Nitori, dianggap oleh sebagian besar orang sebagai salah satu gadis tercantik di sekolah, tetapi yang membuatnya kecewa, dia sebenarnya secara biologis adalah laki-laki. Untungnya, Shuuichi memiliki teman masa kecil yang memiliki perasaan tidak nyaman serupa terkait identitas gender: si tomboi kurus Yoshino Takatsuki, yang, meskipun secara biologis perempuan, tidak mengidentifikasi dirinya sebagai perempuan. Kedua sahabat ini berbagi rahasia yang sama dan menemukan penghiburan satu sama lain; Namun, kehidupan mereka menjadi lebih rumit ketika mereka harus memasuki lingkungan asing di sekolah baru, berusaha mendapatkan teman baru, dan berjuang untuk mempertahankan teman lama. Dihadapkan pada rintangan yang hampir tidak dapat diatasi, mereka harus belajar menghadapi kenyataan pahit dalam tumbuh dewasa, menjadi transgender, menjalin hubungan, dan penerimaan.
Dipuji karena pandangan serius tentang identitas gender dan perjuangan LGBT, Hourou Musuko karya Takako Shimura berkisah tentang upaya Shuuichi dan Yoshino untuk menemukan jati diri mereka saat memasuki masa puber, berteman, jatuh cinta, dan menghadapi beberapa pilihan yang sangat nyata dan sulit.
