Misi 100 Tahun: misi yang sangat menantang dan berbahaya sehingga belum pernah tercapai selama lebih dari satu abad. Meskipun banyak penyihir telah mencoba untuk mencapai tujuan yang melelahkan ini, hasilnya berakhir dengan kekalahan telak atau lebih buruk. Meskipun demikian, Natsu Dragneel dan teman-temannya—Lucy Heartfilia, Gray Fullbuster, Erza Scarlet, dan Wendy Marvell, bersama dengan Happy dan Charlés—dengan ambisius memulai misi tersebut.
Setahun setelah serikat Fairy Tail mengalahkan kekuatan jahat Acnologia dan Zeref, Natsu dan timnya melakukan perjalanan ke benua utara Guiltina, tempat mereka mencari majikan Misi 100 Tahun dan menerima misi yang hampir mustahil: menyegel Lima Dewa Naga—sekelompok individu dengan kekuatan yang sangat besar yang, jika dibiarkan, dapat menyebabkan kehancuran global. Sementara itu, anggota baru yang bersemangat bernama Touka direkrut ke Fairy Tail. Meskipun energinya yang bersemangat dan sifatnya yang penuh gairah membuatnya cocok untuk serikat tersebut, tampaknya ada lebih banyak hal dalam dirinya daripada yang terlihat.
Bertekad untuk menyelesaikan misi mereka yang tampaknya mustahil, Natsu dan teman-temannya memulai pencarian berbahaya mereka terhadap Dewa Naga. Namun, setelah bertemu dengan guild gelap baru bernama Diabolos, bersama dengan rekrutan terbaru Fairy Tail yang mengungkapkan warna aslinya, Natsu dan timnya akan menemukan bahwa Misi 100 Tahun bukanlah satu-satunya tantangan yang mereka hadapi
