Haruyuki Arita adalah seorang siswa SMP yang kelebihan berat badan dan sering diintimidasi, yang menemukan penghiburan dengan bermain game online. Namun, suatu hari hidupnya berubah drastis, ketika dia menemukan bahwa semua nilai tertingginya telah dipuncaki oleh Kuroyukihime, wakil ketua OSIS yang populer. Dia kemudian mengundangnya ke ruang tunggu siswa dan memperkenalkannya pada “Brain Burst”, sebuah program yang memungkinkan pengguna untuk mempercepat gelombang otak mereka ke titik di mana waktu seolah-olah berhenti. Brain Burst juga berfungsi sebagai game pertarungan augmented reality, dan untuk mendapatkan lebih banyak poin untuk berakselerasi, pengguna harus memenangkan duel melawan pemain lain. Namun, jika pengguna kehilangan semua poinnya, mereka juga akan kehilangan akses ke Brain Burst selamanya.
Kuroyukihime menjelaskan bahwa dia memilih untuk menunjukkan program ini kepada Haruyuki karena dia membutuhkan bantuannya. Dia ingin bertemu dengan pencipta Brain Burst dan mengungkap alasan mengapa Brain Burst diciptakan, tetapi itu lebih mudah diucapkan daripada dilakukan; untuk melakukannya, dia harus mengalahkan “Enam Raja Warna Murni”, pemimpin faksi yang kuat di dalam game, dan mencapai level 10, level tertinggi yang dapat dicapai. Setelah gadis itu membantu Haruyuki mengatasi para pengganggu yang mengganggunya, dia bersumpah untuk membantunya mewujudkan tujuannya, dan dimulailah pertarungan keduanya untuk mencapai puncak.
